Gene detail

Detailed information of XP_065654506.1 in Hydra vulgaris

Genomic Location: NC_088925.1:5362934...5365538
NR annotation: XP_047140936.1, uncharacterized protein LOC105843584 [Hydra vulgaris]
Species abbreviation HVULG · all data for this species · gene families

Gene Structure

More details in JBrowse

Sequence

CDS

LOC136081141

ATGGTTTCCGTGGTAATCAATTGCAAAAGTTCAAGAAAAATCAAAACTGTACTTAAAGCACCTTTATCACCTGAAAGGATAACAGAACTAAATTGTATATATCTGAATGCTACCTCACTCGAAAATAAATTAGATGAATTAAAGGTTGTAACTAGTTTGTATGGTCCTAAAATTGTTGAAGTAAGCGAAACATGGTTCAAAAATAACTCAATTGTAAATATTCCTGGGTACAATATATACAGATATGATAGAACTGGTGATCGTAGAGGCGGCGGTGTATGCTTATATATAAAAAATTCAATAGATTCATACGAACTGGTCGACACTGATTTTAGTATTGACAAAATAAAACAAGTTTGGGCAGTAGTTTATTTTGGCCAAGATAAGTATCTAGTTGGTTGTCTATACAGACCAAATTACTTTGTTGATATGGTAGACTTTGACAATATTTTTAAAATAGCAAGAAGATATGTTGATGTTAATGCCTTTAAAGATGTACTAATTATGGGTGATTTCAATTTCCCAGCTATTAAATGGTCAAATGGTAGTATAGCATCAATTTCAAATGACAGTGGCATAGAACATAAATTCTATAAAACTTTAAGTGATACTTTCCTCTATCAACATATAAACATACCAACTTTTTATTTGGCTAATGGCTCAACCTCAAATATTCTAGATTTAATATTCACAGCAGAATCTGGCAGTATATATGCTGTTAATCCAAGTTTTGTGCTTGGTGACATAAACAAAGGTCATCAAATTATTTACTTTAAATTCGTCTTAAAAAAAAATGTTAGCAGATTAGCTTGTAGTAACTTAAAGTTTTTGCATAGCAAAGCTAAATTTGATAAAATTTCTGATTTTATGTCCTATACTAATTGGGTGAAGTTGTACGAAAACAAGATAGTGCAAGACATGTACAATGAATTAATTTACTATACCACTGAAGCATGTAATTTGTTTGTTCCAACCATAGACATTTTACGAACCAAAAGCTTAGCAACTCCTTGGAATAATAACGAAATCAAGCAGTTAATAAGAAGAAAAAGAAATTTAAGATACATAAATTGTGCTCACAGATGGAATGATGTTAAACTGACCAAAGAATATAAACATTTATGCAAATTAGTTAAAACAGAAATATACAATGCTCGACTTTTATTTGAAAAGAATCTAGTGTTAACCTCTAAACTTAATCCTAAACTGTTATATAAGTATTTAAACAGTACAAATTCAATAAAAGACTCAATAAAGGCCATGAGAATGCCTGATGGCGATTTATCCCATGAACCAAATAAAATTGTTAACTGCCTAAATAAACATTTTCAGGATGTCTTTACTATTGAAGAAAAAGGAGATCTTCCACCTTTTTATCTCGAATTAAATAATGTAATTAAATTTGAGGAAATTGAACCTGATGATATTAGCTTTGAAGAATCACTTAAAACCAGTCAACTGCCAATCCAGTTCAAGTCAGCAAATGTAACACCTATATATAAAAAAGGTGACAAAACAGTGGCCAGCAATTATCACTCTATTTCACTAACTTCTATTCCTTGCAAAATATTAGAATCTATTATAAAAGAAAGAATTGAAAAACATCTCAACGAAAACAATTTACTAACCATCCAACAGCATGGTTTTGCAAAAGGAAAGTCTTGTACCACAAATTTGTTAGAGACTCTTGACTTTATTTCTTTGTGCAACAGTGATGGTATACCTGTTGATGTAGTAATGCTAGACTTTGCTAAAGCTTTCGATAGTGTTCCTCACAAAAGACTCTTTGCTAAATTAAATGCATATGGTATTAATGGCATAGTTCTAAAATGGATAGAAGCTTTTCTAAATAATAGAAGACAAAGAATAGTTCTAGGTGAAGTTGCTTCTGAGTGGGTTGAAATTTTTAGTGGTGTGCCACAAGGCTCTGTTATTGGACCCTTAATGTTTATTATATACATTAACGGTCTGCCAAGTAAATTAATGGATAAATGCAAATTGTTTGCTGAAGATACTAAGATTTTGTCCAAGGTACTTTCTGATGAGTGTACCTCAAGTCTACAGAGGGATTTAAATACATCATTTAAATGGACAGAAGACTGGCTTTTAAAGTTTAATGTTGATAAATGTGTAGTAATGCACTATGGAGTAAACAACAAAAAGAATCCTCTATATATTAATGGCATAAAACTACCAGAATCAAATAGCGTAAAAGATCTAGGTGTAATATTTTCTAAAAATCTCAAGTGGAAAGATCAAGTTATTGCTCCAACAAATAATGCAAATAGAATGTTAGGTCGAATTAAAAAATCGTTTGCAAGATGGGACTGTCATTTACTTAAATTACTATACGTAACCTTTATTCGTCCATTTCTAGAGTTCTCAGTTCCAGTATGGTCCCCGTACCAAAAAAGTGACTGTAAAGTAATTGAACAAATTCAGCGTCGAGCCACCAAACTGATTCACAGGTCACTGTTTTAA

Transcript

rna-XM_065798434.1

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Protein

UniProt (Swiss-Prot top hit)

UniProt accession	Description
Q95SX7	Probable RNA-directed DNA polymerase from transposon BS OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=RTase PE=2 SV=1
Q9NBX4	Probable RNA-directed DNA polymerase from transposon X-element OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=X-elementORF2 PE=3 SV=1
P03876	Putative COX1/OXI3 intron 2 protein OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=AI2 PE=4 SV=2

Gene family

Family type	Membership / link
Orthogroup (gene family)	OG0000005 (this species only)

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00078 all species →	RVT_1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)	Domain	Interproscan
PF03372 all species →	Exo_endo_phos	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000477 all species →	Domain	Reverse transcriptase domain	Interproscan
IPR036691 all species →	Homologous_superfamily	Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamily	Interproscan
IPR005135 all species →	Domain	Endonuclease/exonuclease/phosphatase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR33395 all species →	TRANSCRIPTASE, PUTATIVE-RELATED-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0007508 all species →	Biological Process	larval heart development	Interproscan
GO:0031012 all species →	Cellular Component	extracellular matrix	Interproscan
GO:0061343 all species →	Biological Process	cell adhesion involved in heart morphogenesis	Interproscan
GO:0003824 all species →	Molecular Function	catalytic activity	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

No KEGG orthology assignment for XP_065654506.1.

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.