Gene detail

Detailed information of XP_065661663.1 in Hydra vulgaris

Genomic Location: NC_088928.1:37507163...37538546
NR annotation: XP_047133078.1, uncharacterized protein LOC100201735 [Hydra vulgaris]
Species Hydra vulgaris · all data for this species · gene families

Gene Structure

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Sequence

CDS

LOC100201735

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Transcript

rna-XM_065805591.1

ACTTTGTTAGTTTCTAGCGTTCTTTTGGATGATTcaaaataaggtttttaaattttaataaaacgcagacctaaaaattatagttaataCTTGTAATAGTAGTAGAAGATTATGACTTTTTAAAGTctctgttttattaaaaatttaaaaatcttattttgaatcATCCAAAAGAACCGTTTTCAGTCAAATGTGATTTCCGCTTTTCCGTTTCTATGATTTAAAAAACGACCTTAACGTTCAGCTTATACTTTGTAGTTAAAATGACTTcagaatttaaaagttttatggaACTGCATGAACCGCAGTTGAAATGCATAAATTTTCCTTCTCAACTTTTTGAAACGTTGTTTCATATGCTTAGTAGAAAAACTACCGGGGATGTTGCAGATGAACTCAAGGTTACCAAAGTTCATAATTCAGctgcAATGCTACTTACTCAAAAAGATTTAACTGCAAATGGCTGTTGTTTTATATCACGTCATCTTTGGTCAACAGATTATTCCAAGAAAAGTATTAATGAGTTAAAAGCAAATGCTTCACTTTTGGATAGCCTTGCTggtatatttaatatatctgCACAACTTCAGTTTGATGAGTTTCAAAATTATTCGCAACAAAAGTATAATGTGGAAAAAGTATATCCAAGTTCTAATAAGGACACAATAAATACCGTTGTAGAACAGTGTGATGGTGATACATTATTAGCACTTATGAAACTTGAAGATGGTGACTATAAAAGCAAATCCTTATCAGCAAGTACTCCAGAGTGttcttttaatgaatttaaagcAGCATTAGTATCTTGCGGCTACAACATAGAAACCTTCAATGATAATTACTTGCATAAAATGCATCTTAATTTTGTCAAAAGTGGAAAAGGAAGCGGTACAACATTGCTGTATAACTGGCATGAAGATAatgaagaaaaagttatttttgtatatgtatCTATTCCTTCAACTGCAAAAAAAAGAGATATCACTAGTAATTTAAAAAGGAACTCTTGGGAACTGATTGTCAatggtaaaattttaattagtggtaatctttttaatgcaataaaagtTGATAGCTCATTTTGGTCTATTGATGAACCTGGTTTATTATGTATGACAATTGAAAAAATGGATGTTGAAGAAGTTTGGGAGgaattAATCAAAGATGAAGTGAAATTGTCATCAGCGGAAATTCTTCACCAGTTTTGGATCAAACAGAAATGTttcaatctttatttttctgACATATTGGATAGCATGTGGAAGTACAATCAAACTTATAGCTTACCTAGTTCTGGTAAACGTCGTCCGACTTGGTATGTCATGGATGCATATGGTTCTGCCCTTACTCATGCACGTGACCCAAACTTCAAGTGTGCTCCATTTTTTTATGTGCCAGATAACCagtttattaacatattttggCCTATAAAAGACATATCAAAAGGTATGAGGTGTACACGCGATTATATTCCACCCCTTTTTTCTAACGAAAGTGCAGACATTCAGCGTGTTcgattaaaagcatttttaggaaaaaaactgTCCTCTACGCAGTTAGGTCTTGCTGAATCTGATGATCAAAATAAGGAAGAAAAGAACGAATACCAAAAAGTCAAGTTAGTTTCACTTAATAATGTTAGTCGAACGCAGATAACTAgcaaaaagatatttgtaaGTGGTATGCcaattgaaaaaatagaaaaactaaacaagatgttagatttaaatattttagttaatgaGAAGGAAGctgacattaaaattttaactcttAGTGATACATTGATGGATTTGGGGGGAGATTTTGTTCGCTCTTTTGAGGTTTTTTCAAGTCGCGATTTTTTACAGAGCTATTTTCAGTataggtttaataaaaatagttggCTGTTTAAAAGTATGATACTTCCGCGTGATTTGGttctttttaatgaagaatttgaaaaatgtgATCTCCCTCAACATTGGATTATTAAATCATCTTCAAAGATAACATTAGACATTTCTGTACACGTAACAAGCAAATTTTCTAGAATAGTTCGTATGTGCGAAGTTGGTCCCATAGCTGTGACTAAATTTGTATCAACACAACCTCTCTTTCGGAGTTGTCGTTTCGCTCTTCGTTATTATGTACTTCTTACCCACTCTTCTGTCTTTATTTGCACAATCCCATATATTCGATTGTCGGAAGATAAATCTAGTCAAAAcgattttattaatgaatacgACAATGCAGCAACTATTACTGAATCGGCATTAATTCAAGATGAcgatatatttattgaatttaaaacagCGATGAACAAATTGTTGTTACCCGTAAATCCTAAAAGAGGATGGAGTTATTTTGAAgaagatttgtttaaaaaaattggttatttCAGTAAAATATTGTCAGGTGATTTAAAGTACAATGAAAATAGTCTGGTAATGTTTTCTATCGACTTTATCATCGACGAAAATTTTGAAGCTCGAATGGTCGATATTGACGATGTTTATATCTCACCTGATCAAAAGGTCTTGCTCGGTGCATTTAATCTAGCTCTTGGTTATGATAGCGCTCAGTTTATTAAAGttgaaattagttaaaaatagaaaaattataatttaaa

Protein

UniProt (Swiss-Prot top hit)

No Swiss-Prot hit above the reporting threshold for this gene.

Gene family

Family type	Membership / link
Orthogroup (gene family)	OG0008607 (this species only)

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04969 all species →	CS	CS domain	Domain	Interproscan
PF03133 all species →	TTL	Tubulin-tyrosine ligase family	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR007052 all species →	Domain	CS domain	Interproscan
IPR008978 all species →	Homologous_superfamily	HSP20-like chaperone	Interproscan
IPR027749 all species →	Family	Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12	Interproscan
IPR004344 all species →	Family	Tubulin-tyrosine ligase/Tubulin polyglutamylase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46088 all species →	TUBULIN--TYROSINE LIGASE-LIKE PROTEIN 12	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0005737 all species →	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0036211 all species →	Biological Process	protein modification process	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

No KEGG orthology assignment for XP_065661663.1.

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.