Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 95 gene–annotation pairs matching PF12063 across 148 genomes · 8638 ms.

Species with hits:AMYRI 6BWELL 4DCRIB 4AAUST 2MMEAN 2MLORD 2MEFFL 2MCACT 2PMEAN 2LPERT 2EHORR 2DPERT 2DLINE 2OARBU 2CGIGA 2PSINE1 2SRADI 2RFLOR 2ASPAT 2AEQUI 2ROSCU 2AMEDI 2AINTE 2PXISH 1OFRAN 1OPATA 1TRENI 1PACUT 1TCOCC 1PCRUS 1SINTE 1PCYLI 1PDAMI 1PVERR 1PMIZI 1SCALL 1PPENN 1PSINE2 1PSPEC 1OFAVE 1MCAPR 1NVECT 1CJARD 1AFLOR 1AGEMM 1AHEMP 1AIDSS 1APALM 1APOCU 1ATENE 1AXANT 1CGRAC2 1CNATA 1MSENI 1CSALA 1DCYLI 1EDIAP 1LSCAB 1MAURE 1MCAPI 1AAWI 1MFOLI 1MSENA 1TSTEP 1
SpeciesGene IDPfam termMatchSourceBrowser
AAUSTENSKKQP00000048010.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AAUSTENSKKQP00000047998.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AAWIaawi_s0283.g5.t1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AEQUIEGACTEQ4350053892-PAPF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AEQUIEGACTEQ4350048485-PAPF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AFLORaflo_s0094.g27.t1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0051.g29.t1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AHEMPAhemp_008257-T1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AIDSSalvinactis_v1_g6404PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AINTEaint_s0339.g5.t2PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AINTEaint_s0339.g5.t1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AMEDIENSQPTP00000027589.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AMEDIENSQPTP00000071552.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AMYRIBRAKERYMEP00000002805.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AMYRIg18469.t1.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AMYRIg18469.t2.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AMYRIBRAKERYMEP00000002807.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AMYRIg18469.t3.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AMYRIBRAKERYMEP00000002806.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
APALMXP_074635709.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
APOCUevm.model.Ap3.1586PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
ASPATENSEWQP00005002726.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
ASPATENSEWQP00005002739.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
ATENEXP_031569627.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
AXANTENSOJPP00000038903.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
BWELLBRAKERLUSP00000033356.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
BWELL14835_t.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
BWELLg15595.t1.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
BWELLBRAKERLUSP00000032020.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
CGIGAENSKFPP00000021933.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
CGIGAENSKFPP00000021921.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
CGRAC2BRAKERTYJP00000030652.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
CJARDENSAVKP00000044205.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
CNATAFUN_006101-T1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
CSALAENSOFVP00000014324.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DCRIBg25015.t2.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DCRIBBRAKERRLHP00000029705.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DCRIBBRAKERRLHP00000029704.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DCRIBg25015.t1.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DCYLIFUN_005451-T1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DLINEENSDLIP00000016676.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DLINEENSDLIP00000016692.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DPERTKAJ7387639.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
DPERTKAJ7387651.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
EDIAPKXJ25090.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
EHORRENSJVNP00000017186.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
EHORRENSJVNP00000017196.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
LPERTOS493_000974-T1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
LPERTOS493_000988-T1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
LSCABANN25144-RAPF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MAUREENSIHXP00000012122.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MCACTBRAKERNUSP00000000235.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MCACTg34792.t1.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MCAPIg35451.t1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MCAPRXP_068748175.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MEFFLENSTIFP00000037121.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MEFFLENSTIFP00000037101.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MFOLIXP_068677925.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MLORDENSSYXP00000048257.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MLORDENSSYXP00000048259.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MMEANENSVBPP00000001294.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MMEANENSVBPP00000001319.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MSENAENSVTRP00000008934.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
MSENIENSDTNP00000001185.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
NVECTXP_032234130.2PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
OARBUENSPTBP00000008479.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
OARBUENSPTBP00000008460.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
OFAVEXP_020609850.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
OFRANXP_081302488.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
OPATAKAL9980028.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PACUTPocillopora_acuta_HIv2___RNAseq.g16688.t1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PCRUSPcrG008023.mRNA1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PCYLIENSZOFP00000009799.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PDAMIRMX37792.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PMEANCAH3109852.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PMEANCAH3109841.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PMIZIc0106.g017.t1.p1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PPENNENSDKPP00000035793.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PSINE1g12275.t1.1.67252f2dPF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PSINE1g12275.t1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PSINE2evm.model.contig_10952.5PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PSPECpspe_0.1.m1.34129.m1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PVERRXP_058940612.2PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
PXISHHK74SY85_g13839PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
RFLORENSORFP00005043275.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
RFLORENSORFP00005029974.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
ROSCUENSJQFP00000019923.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
ROSCUENSJQFP00000019902.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
SCALLNY_Scal100_v1.4735.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
SINTEENSDDJP00000002285.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
SRADIENSTHXP00000016366.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
SRADIENSTHXP00000016333.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
TCOCCTcoG031008.mRNA1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
TRENIENSHNZP00000005797.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse
TSTEPBRAKERFUXP00000039474.1PF12063Atg1-like, MIT domain 1InterproscanJBrowse

TOP