Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

InterProPfamKEGG pathwayGene OntologyPANTHER
Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 211 gene–annotation pairs matching PF04056 across 148 genomes · 7729 ms.

Species with hits:AMEDI 6HECHI 5CJARD 4EHORR 4ASPAT 4PHARR 4PPENN 4MCOMP 3CGRAC1 3PGRIS 3AAURI1 3PSINE1 3RESCU 3ROSCU 3SRADI 3HCOER 3MLORD 2HOCTO 2HVIRI 2LSARM 2MCACT 2EVERR 2ECAVO 2MEFFL 2PCYLI 2MSENI 2NNOMU 2PCLAV 2DCYLI 2PEVER 2PLUTE 2PNOCT 2PRUS 2RFLOR 2SMALA 2TCOCC 2TRENI 2TRUBR 2TSTEP 2DLINE 2MAURE 2DCRIB 2CNATA 2ACYTH 2AEQUI 2AMYRI 2APOCU 2ASP3 2ATENE 2DAXIF 2CCOCK 2CGIGA 2XSP 2CSP2 2CQUIN 1APALM 1PSPEC 1PSINE2 1ALIUI 1ALORI 1DPERT 1PPAPI 1PMIZI 1PVERR 1PLOBA 1APULC 1ASP1 1ASP2 1PDIVA 1PDAMI 1PUMBR 1PXISH 1PCRUS 1ADIGI 1AAUST 1TSP 1ACERV 1DGIGA 1TMAIP 1TKITA 1TDOHR 1SSIDE 1AINTE 1CXAMA 1SPIST 1AGEMM 1SINTE 1SCALL 1AHEMP 1AIDSS 1EDIAP 1PCOMP 1HIMPE 1LSCAB 1BCFM 1FANCO 1MCAPR 1MCAPI 1GFASC 1AAURI2 1MALCI 1CGRAC2 1MGRIS 1LPERT 1HVULG 1CHEMI 1HSYMB 1HSALM 1HOLIG 1CMOSA 1MFOLI 1MHONG 1CSP1 1NSEPT 1PAUST 1PACUT 1OPATA 1OFRAN 1CSALA 1OARBU 1NVECT 1ATENU 1AYONG 1MVIRU 1MSQUA 1AXANT 1MSENA 1MPAPU 1MMURI 1MMEAN 1OFAVE 1
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